Παλιό Χωριό
Αν επιλέξετε ένα από τα δρομολόγια για Αλόννησο, μη χάσετε την ευκαιρία να επισκεφθείτε την παλιά πρωτεύουσα του νησιού, η οποία αποτελεί ένα στολίδι αρχιτεκτονικής γεμάτη δαιδαλώδη σοκάκια και λιθόχτιστα διώροφα σπιτάκια με ολάνθιστα μπαλκόνια. Σήμα κατατεθέν του οικισμού είναι το μεσαιωνικό κάστρο, απ΄ όπου μπορείτε ν’ ατενίσετε το Αιγαίο και το ωραιότερο ηλιοβασίλεμα του νησιού.
Ιστορικό και Λαογραφικό Μουσείο
Αυτό το ξεχωριστό μουσείο στο λιμάνι Πατητήρι προσφέρει ένα μοναδικό παράθυρο στην ιστορία και τις παραδόσεις του νησιού μέσα από διάφορα καθημερινά αντικείμενα. Ένα μέρος της συλλογής του περιλαμβάνει εκθέματα από πειρατικά καράβια, φωτίζοντας τη δράση των πειρατών στο νησί μεταξύ 16ου και 18ου αιώνα.
Στενή Βάλα
Το παραθαλάσσιο χωριό με το γραφικό λιμανάκι που θυμίζει φιορδ, είναι ένας από τα πιο όμορφους οικισμούς της Αλοννήσου. Κυκλωμένο από πυκνά πευκοδάση και ελαιώνες, προσφέρει μοναδικούς περίπατους στη φύση ενώ το αγκυροβόλι του είναι αφετηρία για θαλάσσιες εξερευνήσεις στα γύρω νησάκια. Στο χωριό λειτουργεί καταδυτικό κέντρο και Κέντρο Περίθαλψης της Εταιρίας για την Μελέτη και Προστασία της Μεσογειακής Φώκιας (Mom).
Υποβρύχιο Μουσείο Αλοννήσου
Το πρώτο μουσείο του είδους στην Ελλάδα ξεκίνησε να λειτουργεί το καλοκαίρι του 2020, αξιοποιώντας τον υποθαλάσσιο πλούτο αρχαίων ναυαγίων της Αλοννήσου. Ο πρώτος ενάλιος αρχαιολογικός χώρος που άνοιξε για τους φίλους της κατάδυσης είναι το εντυπωσιακό ναυάγιο αμφορέων του 5ου π.Χ. αιώνα στην νησίδα Περιστέρα, ένα από τα διασημότερα της κλασικής αρχαιότητας. Στη Χώρα θα λειτουργεί Κέντρο Ενημέρωσης όπου, μεταξύ άλλων, δίνεται στον επισκέπτη η δυνατότητα εικονικής κατάδυσης με χρήση τεχνολογικών εφαρμογών επαυξημένης πραγματικότητας.
Εθνικό Θαλάσσιο Πάρκο Αλοννήσου
Ένας από τους σημαντικότερους βιότοπους στην Ευρώπη, αυτό το εκθαμβωτικό υδάτινο οικοσύστημα φιλοξενεί σπάνια χλωρίδα και πανίδα όπως τη μεσογειακή φώκια Monachus Monachus, δελφίνια, κοράλλια και άλλα είδη υδρόβιας ζωής. Το πάρκο καλύπτει ένα νησιωτικό σύμπλεγμα που περιλαμβάνει την Αλόννησο, τα ερημονήσια Περιστέρα, Κυρά Παναγιά, Ψαθούρα, Πιπέρι, Σκάντζουρα, Γιούρα και 22 βραχονησίδες. Τα σημεία του πάρκου που είναι ανοιχτά στο κοινό προσφέρονται για κολύμπι, ελεύθερη κατάδυση ή παρατήρηση της άγριας ζωής.
Άγιοι Ανάργυροι
Χτισμένα στην άκρη ενός του γκρεμού και κυκλωμένα από υπέροχα πευκοδάση, τα δίδυμα βυζαντινά ξωκλήσια των Αγίων Αναργύρων (13ος αιώνας) προσφέρουν φανταστική θέα στην θάλασσα. Το πευκόφυτο μονοπάτι που ξεκινά από τη Χώρα και οδηγεί έως εδώ, αποτελεί ένα από τα πιο γραφικά τοπία της Αλοννήσου.
Κυρά Παναγιά ή Πελαγονήσι
Σ’ αυτό το ερειπωμένο νησάκι απέναντι από την Αλόννησο αναπτύχθηκε και άκμασε η αρχαία Αλόννησος. Σήμερα, ο επισκέπτης μπορεί να περιηγηθεί σε σημαντικά μνημεία πολιτισμού όπως το ιστορικό μοναστήρι της Κυρα Παναγιάς (12ος αιώνας), ο αναπαλαιωμένος αλευρόμυλος και το αναστηλωμένο ελαιοτριβείο ή να κολυμπήσει στις εξωτικές παραλίες Άγιος Πέτρος και Πλανήτης.
Μπλε Σπηλιά
Ένα από τα εντυπωσιακά και πολυφωτογραφημένα φυσικά αξιοθέατα της Αλοννήσου, η εκθαμβωτική θαλασσοσπηλιά κοντά στα νησάκια Περιστέρα και Παναγιά είναι ένα υδάτινο υπερθέαμα σε όλες τις αποχρώσεις του τυρκουάζ με υπέροχους γλυπτικούς σταλακτίτες στην οροφή της.